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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00221 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  2.3 KB  |  51 lines
  1. ****************************************
  2. * Nerve growth factor family signature *
  3. ****************************************
  4.  
  5. Nerve growth factor (NGF or beta-NGF) is a vertebrate protein that  stimulates
  6. division and differentiation  of sympathetic and embryonic sensory neurons [1,
  7. 2]. NGF is  a protein  of  about  120  residues that is  cleaved from a larger
  8. precursor molecule.  It  contains  six  cysteines  all  involved in intrachain
  9. disulfide bonds.  A  schematic representation of the structure of NGF is shown
  10. below:
  11.  
  12.                                     +------------------------+
  13.                                     |                        |
  14.                                     |    *******             |
  15.         xxxxxxCxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxCxxxxCxxxxxCxxxxxxxxxxxxxCxCxxxx
  16.               |                          |     |               |
  17.               +--------------------------|-----+               |
  18.                                          +---------------------+
  19.  
  20. 'C': conserved cysteine involved in a disulfide bond.
  21. '*': position of the pattern.
  22.  
  23. Some proteins have been found [3] to be structurally and  functionally related
  24. to NGF, these are:
  25.  
  26.  - Brain-derived neurotrophic  factor  (BDNF), a  protein   that  promotes the
  27.    survival of neuronal populations all located either in the central  nervous
  28.    system or directly connected to it.
  29.  - Neurotrophin-3 (NT-3), a  protein that  seems  to  promote  the survival of
  30.    visceral and proprioceptive sensory neurons.
  31.  - Neurotrophins-4/5 (NT-4/5), which  elicit  neurite outgrowth from explanted
  32.    dorsal root  ganglia  and  could  play a role  in  oogenesis  and/or  early
  33.    embryogenesis.
  34.  
  35. The pattern  we have developed for  the NGF family spans the central region of
  36. these  proteins  and  include  two of the six cysteines  involved in disulfide
  37. bonds.
  38.  
  39. -Consensus pattern: G-C-[KR]-G-[LIV]-[DE]-x(3)-[YW]-x-S-x-C
  40.                     [The two C's are involved in disulfide bonds]
  41. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  42. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  43. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  44.  
  45. [ 1] Levi-Montalcini R.
  46.      Science 237:1154-1162(1987).
  47. [ 2] Bradshaw R.A., Blundell T.L., Lapatto R., McDonald N.Q., Murray-Rust J.
  48.      Trends Biochem. Sci. 18:48-52(1993).
  49. [ 3] Lo D.C.
  50.      Curr. Biol. 2:67-69(1992).
  51.